Hiện nay, Đoàn trường quản lý 1.300 đoàn viên, sinh hoạt trong 02 liên chi đoàn với tổng số 50 chi đoàn và 01 chi đoàn cán bộ giảng viên trực thuộc. Hiện trong toàn trường có 02 chi bộ sinh viên, sinh hoạt dưới sự chỉ đạo trực tiếp của Đảng uỷ các Khoa.

  Ngoài những hoạt động với chức năng chính là giáo dục chính trị, định hướng tư tưởng cho đoàn viên thanh niên, khơi dậy tinh thần sáng tạo, xung kích, hăng hái đi đầu của thanh niên trong các lĩnh vực học tập và nghiên cứu khoa học, xây dựng và bảo vệ Tổ quốc, chung sức vì cộng động.
        Trong 20 năm vừa qua, dưới sự lãnh đạo trực tiếp của Đảng uỷ, Ban Giám hiệu, Đoàn thanh niên trường đã đạt được nhiều thành tích trong phong trào Đoàn và công tác thanh niên. Nhờ những thành tích đã đạt được, rất nhiều tập thể và cá nhân trong trường đã nhận được nhiều bằng khen của Trung ương Đoàn, của Thành Đoàn Hà Nội, và đặc biệt là các tỉnh đoàn qua những hoạt động mùa hè xanh tình nguyện. Cũng nhờ những hoạt động và thành tích như vậy, mỗi năm có hàng chục đoàn viên ưu tú được giới thiệu và có vinh dự trở thành Đảng viên Đảng Cộng sản Việt Nam. Trong thời gian tới, Đoàn thanh niên trường sẽ tiếp tục thực hiện cuộc vận động "Tuổi trẻ Việt Nam học tập và làm theo lời Bác". Đây một cuộc vận động mà nội dung của nó đã bao hàm tất cả các mục đích, ý nghĩa và các mặt hoạt động của Đoàn viên, thanh niên. Đoàn TNCS Hồ Chí Minh trường Đại học Đông Đô tin tưởng rằng, dưới sự lãnh đạo của Thành Đoàn Hà Nội, của Đảng uỷ, Ban Giám hiệu, phong trào Đoàn và công tác sinh viên của trường ngày càng phát triển mạnh mẽ và đạt được nhiều thành tích hơn nữa để xứng đáng là Đoàn viên, sinh viên của một trường là đơn vị Anh hùng lao động thời kỳ đổi mới, Anh hùng lực lượng vũ trang và đã nhận được nhiều phần thưởng cao quý khác, do Đảng và Nhà nước trao tặng.

          Đoàn thanh niên cộng sản Hồ Chí Minh là tổ chức chính trị - xã hội của thanh niên Việt Nam do Đảng cộng sản Việt Nam và Chủ tịch Hồ Chí Minh sáng lập, lãnh đạo và rèn luyện. Đoàn bao gồm những thanh niên tiên tiến, phấn đấu vì mục tiêu, lý tưởng của Đảng là độc lập dân tộc gắn liền với chủ nghĩa xã hội, dân giàu, nước mạnh, xã hội công bằng, dân chủ, văn minh.

         Đoàn thanh niên trường đại học Đông Đô được thành lập ngày 15/12/1999 theo quyết định số 75/QĐ-TNHN về việc công nhận tổ chức Đoàn thanh niên trường Đại học Đông Đô.

         Đến nay, đoàn trường đã trải qua 5 nhiệm kỳ hoạt động, với nhiệm kỳ hiện tại (2012 – 2017) bí thư đoàn trường là đồng chí Nguyễn Minh Đắc

Trong thời 15 năm hình thành và phát triển, Đoàn trường đã tổ chức được nhiều hoạt động nổi bật như:

- Chương trình Haloween 31/10 và chào đón Tân sinh viên Đông Đô

- Chương trình thường niên kỷ niệm ngày nhà giáo Việt Nam 20.11

- Chương trình Hiến máu tình nguyện

- Lễ kỷ niệm thành lập Hội sinh viên Việt Nam (09/01)

- Festival sinh viên Đông Đô

- Giải bóng đá sinh viên

- Cuộc thi tìm hiểu về tấm gương đạo đức của chủ tịch Hồ chí minh

- Tổ chức Tặng quà nhân dịp Trung thu cho trẻ em nghèo

- Các hoạt động tình nguyện mùa hè như Tiếp sức mùa thi và Phổ cập tin học

- Tổ chức Hội trại “Sức trẻ Dong Do University” và “Miss HDIU 2014”

- Ngoài ra Đoàn trường còn đứng ra tổ chứcc các chương trình chiếu phim, văn nghệ thường niên của Hội sinh viên, tham gia vào các chương trình tình nguyênh của Thành đoàn Hà Nội

- Các hoạt động ủng hộ đồng bào lũ lụt, chương trình Áo ấm mùa đông…